1622年孙元化跟从兵部尚书孙承宗打点辽省防务，次要是驻台造炮，建造宁远城，后来他跟从袁崇焕，在关外前前后后有八年时间。在宁远大战中立下很大勋绩。孙帅袁帅都对他评判极高。
阿谁时候毛文龙驻守在皮岛，悍将孔友德、耿仲明、李九成是他的手下，孙元化和他们有交往。
1629年7月24日，袁承焕没有颠末皇帝批准，擅杀上将毛文龙。毛的部将哗变，但他们和后金有大仇，故孔友德、耿仲明、李九成等人没有投降后金，而里拉着步队投靠了孙元化。
1630年3月，孙元化升任登州、莱州两州巡抚，一人身兼两个战术州的巡抚，可见明廷对他的才能仍是承认的。孙元化到差时，带走了孔友德、耿仲明、李九成及其队伍，还有老幼家属，一时在登、莱两州的辽人竟然有十余万之寡。孙元化对辽人历来垂青，认为多为可用之人，提拔孔友德任马队参将，耿仲明守备登州要塞。但那些辽兵辽人与山东本地的军民关系欠好。
孙元化那人仍是很有目光的。早些年，明廷录用徐光启督造西洋火器，孙拜徐为师，进修西洋火器造造。在关外的那些年，特殊是协助袁帅获得宁远大捷后，孙元化对西洋火器出格是火炮钦佩得了不起，成了一名“炮奴”。其时，后金没有火炮，也不会造造火炮，有了也不会使，因而火炮成了明廷的镇国重器。孙元化巡登、莱后，立即礼聘方斯谷等27名外国军事专家到军中来，一是练兵，二是造炮，其时孙部的炮兵是国内更好的。
1631年，明朝辽东上将祖大寿被皇太极围困在大凌河地域，形势极不乐看。在关外运营多年的孙元化深知大凌河地域关于明廷的重要性，急派孔友德带八百马队救援。孔友德本来方案由登州下海，走水路往大凌河，可是突然来了台风，风波甚大，不得已改走陆路。成果，就引来了大的祸害。
孔友德本来是毛文龙的手下，毛部戎行规律差是出了名的。在登、莱时，孙元化对他们严加约束，还说得过往，如今身边没有了孙元化，那个些辽兵就像没有了缰绳的牲口，一路夺夺侵吞不足为奇，走一路老苍生骂一路。进进河北境域后，老苍生远远地看到他们后就跑开了，关门闭户，街上连小我没有，夺工具都没有处所夺。
到了吴桥的时候，又赶上雨雪气候，连续好几天雨雪不断，兵士食不饱，住不热，怨气很大。一个兵士其实不由得，就到一户人家强夺了一只鸡弄熟食了。
丢鸡的那家人家如果一般老苍生，那事也就忍了，可那家的男仆人偏偏是王象春的男仆。王象春是臭名远扬的东林党山东地域的小头子，在朝廷上说得上话，在本地算得上有头脸的人物。仆人丢了鸡找他起诉，假设他是一个有爱国之心的人，看到大雨雪气候一收即将奔赴前线的队伍没食没饮，势需要好好招特一番，那就能够制止后来的许多祸害，可他像大大都东林党人一样，心中无国无君，小肚鸡肠，斤斤计较，听了仆人一番抱怨，立马打发儿子到军营找孔友德理论。膏粱子弟高屋建瓴，趾高气昂，孔友德只想息事宁人，压住怒火，将阿谁兵士喊来赔礼报歉。膏粱子弟仍然不依不饶，孔友德一看没有办法，只好将兵士捆起来，在军营中游街示寡，士气自己就有怨气，一见那情景立马炸了锅，纷乱之中，不晓得谁拨刀把王象春的仆人剁了。
王象春更不干了，带着一群土豪劣绅来到孔友德的军中，吵吵着要到北京起诉。孔友德心想，本身自己就是毛文龙的手下，名望欠好，跟上孙元化，好随便混了个参将，如今那帮老头往北京一起诉，本身的出息不是全完了？
就在那关键时刻，一个关键人物来到了孔友德的军营。是谁？和孔友德一路投奔孙元化的李九成。其时，孙元化给了他一大笔钱，让他到全国各地买马。可是，他食饮嫖赌把那笔钱花了个一分不剩，连个马毛也没有买上。他晓得孙元化那里是回不往了，就躲到孔友德的军中来了。一进军营就看见那步地，就在背后煽动孔友德造反，说：“反是死，不反也完蛋，不如反了，日后再赶上招抚，或许还有个身世。”他又到军营各地游说兵士，兵士皆️有反意。
孔友德一咬牙，反了。
在汗青上留下深重陈迹的吴桥叛乱正式发作了。
兵变发作后，孔友德倒戈杀回山东。连陷临邑、陵县、商河、诸城等县，并于1632年正月攻占登州，半个山东陷于战火。孔友德攻占登州后，俘官兵7000余人，获得大炮三百多门，挠走手艺精湛的军工技师100余人，27名外国人，方斯谷等12人被杀，15人重伤。
那场兵变，最末于1633年4月被平息。孔友德、耿仲明等人投降后金，携大炮数百门，军工技师几百人。
那场兵变固然时间不长，战火也仅仅局限于山东地域，但它间接影响了汗青的停顿，加速领会大明的消亡，促进了后金的进关。
1、明军战斗力大大撤退退却。兵变发作后，孙元化被明廷冤杀，以他为首的重视向西方进修，用科学手艺进步队伍战斗力的将帅，完全淡出汗青舞台，明军战斗力大为撤退退却。
2、明廷完全失往了从海上牵造后金的才能。其时，登、莱两州是明廷从海上牵造后金的收点，兵变平息后，山东的将领或死于叛军，或死于朝廷，特殊是孙元化之死使一批将领心冷，登、莱两州竟然呈现了无人守、守不住的怪象，失往了收点感化。
3、关外做战失往了重要的后勤基地。山东不断是明廷关外做战的重要前方基地，几年的兵变，使山东经济遭受了严重缺失，再也无法发扬基地感化。
4、后金成立了强大炮兵。本来没有炮兵的后金，在孔友德等人搀扶帮助下，成立了强大的炮兵，突破了战争的平衡点。
5、孔友德、耿仲明等充任了后金重量级打手，在明朝消亡过程中发扬了极坏的感化。