为了避免种蛋污染，掌握某些疾病和消亡病原微生物，必需对 种蛋严厉消毒。常用的办法有：(1) 福尔马林熏蒸法目前，种蛋和孵化机多摘用那种消毒方 法。对清洁度较差或外购的种蛋，每立方米用42mL福尔马林加21g 高锰酸钾，在温度25〜27°C、相对湿度75%〜80%的前提下，密 闭熏蒸20〜30min，可杀死蛋壳上95%〜98。
5%的病原体。在孵 化器内停止第2次消毒，每立方米用28mL福尔马林加14g高锰酸 钾，密闭熏蒸20〜30min，熏蒸完毕后翻开通气孔，开动风机，排 除孵化器中的福尔马林烟雾，然后再正式升温孵化。(2 )新洁尔灭消毒法用0。1%〜0。2%的新洁尔灭溶液，水温 为40〜43°C,将种蛋浸泡1〜2min,捞出沥干后即可进孵。
或者 摘用喷雾消毒法，将其间接喷洒于蛋的外表。(3 )高锰酸钾消毒法将种蛋浸泡在0。05%的高锰酸钾溶液中 3〜5min,洗蛋的水温应为43〜49°C,每4L溶液洗蛋不超越200 个。捞出晾干后拆盘进孵。(4 )二氧化氯溶液消毒法在每升温水中加进80〜100mg的二氧化氯，喷洒于蛋的外表。
那种办法消毒不毁坏蛋壳的胶护膜, 并且对削减蛋壳及蛋内细菌数效果较好。(5 ) 土霉素盐酸盐溶液消毒法将0。5g土霉素盐酸盐化解于1L 的水中造成消毒液，此消毒液对防治鹌鹑白痢病的消毒效果极佳。(6 )季铵化合物浸泡消毒法配造每升含120mg的季铵化合物 消毒液，水温38°C，浸泡种蛋3min,取出沥干后即可进孵。
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