已知蛋白序列怎么查找基因名称
回答如下:要查找蛋白序列对应的基因名称,可以采用以下几种 *** :
1. 基于基因数据库的搜索:将蛋白序列输入基因数据库,如NCBI、Ensembl等,通过基因名称或蛋白序列相似性进行搜索,找到与该蛋白序列相对应的基因名称。
2. BLAST搜索:使用BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)软件,将蛋白序列与基因数据库中的序列进行比对,找到最相似的序列,并从中获取基因名称。
3. 使用GeneCards等基因信息平台:GeneCards是一个集成了各种基因信息的平台,可以通过输入蛋白序列,查找对应的基因名称和其他相关信息。
4. 基于同源序列的搜索:将蛋白序列输入同源序列搜索工具,如HMMER、Phyre2等,通过比对蛋白序列与已知的同源序列,找到对应的基因名称。
1、首先你写出正确的英文蛋白质名:insulin,hemoglobin
2、到hgnc网站: 输入以上单词进行查询
3、查询结果:inslin:的基因名字ins hemoglobin有很多对应,因为hemoglobin是有很多亚基的,比如你要研究alpha 1亚基,那基因名字就是hba1喽
就这么简单了。
如果你想批量查询就去吧hgnc数据库下来,就ok了。
怎样迅速的获得大量目的基因?
1.从基因文库中获取目的基因(俗称:鸟枪法):将含有某种生物的许多DNA片段,导入受体菌的群体中储存,各个受体菌分别含有这种生物不同的基因,称为基因文库。当需要某一片段时,根据目的基因的有关信息,如根据基因的核苷酸序列、基因的功能、基因在染色体上的位置、基因的转录产物mRNA,以及基因的表达产物蛋白质等特性来获取目的基因。
2.化学合成法。已知目的基因的核苷酸序列,可用DNA合成仪直接合成。
3.用PCR技术扩增技术提取。已知目的基因引物的序列,将整个DNA放入合成仪,因为只有当引物与模板结合后DNA热聚合酶才能行使聚合功能,所以只有引物中间的目的基因被大量扩增,即被提取出来。 参考资料: 人教版生物选修三