如何将项目设计方案转化为学术论文以进行学术交流？

如果是自己写的专利，是没问题的。

从著作权法的角度考虑，你是原作者，当然享有著作权。

从专利法角度考虑，不会影响该专利的新颖性，评价该专利的新颖性是从申请之日起向前检索，目前将进入实审阶段，这样是不会影响该专利文件的新颖性的。