Nature系列重磅综述 | 靶向p53蛋白药物 打破“不可成药”魔咒?

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TP53是一种抑癌基因,被称为“基因组的守护者”,定位于人类染色体17p13.1,共编码393个氨基酸,是细胞生长周期中的调剂因子, 与细胞周期调控、DNA 修复、细胞分化、细胞凋亡等路子有关。p53卵白是由TP53基因编码的一个53kDa的卵白,大大都恶性肿瘤中存在P53肿瘤按捺卵白失活,因而p53卵白是开发抗肿瘤药物的极具吸引力的靶点。然而,到目前为行,美国或欧洲还没有基于p53的治疗药物获批。假设目前开展的临床试验证明任何化合物有治疗效果,那么很可能会突破p53卵白“不成成药”的魔咒,创始癌症治疗的新时代。

2022年10月10日,以色列更好的科学研究所——魏茨曼科学研究所的Moshe Oren传授在Nat Rev Drug Discov上颁发了一篇名为Drugging p53 in cancer: one protein, many targets的综述文章,系统评估了靶向p53卵白功用失活用于癌症治疗所做的测验考试和勤奋,并讨论了临床开发过程中碰着的挑战。

Nat Rev Drug Discov

诱人的癌症治疗靶标——p53

p53做为一个强大的肿瘤按捺基因,其次要感化是“纠错”。通过多种体例按捺肿瘤生长。做为一种转录因子,p53调剂靶基因的表达,那些基因可促进细胞周期停滞、凋亡、DNA 修复等。

此外,p53还能够通过转录非依靠机造按捺增殖。p53 几乎会影响所有细胞器,包罗线粒体、溶酶体、内量网等。TP53基因突变,往往招致p53卵白功用或数量的缺失,存在TP53突变的细胞增殖过程错误百出,大量的反常基因突变无法消弭。

野生型p53的按捺肿瘤感化和突变型p53的致癌感化

癌症相关的TP53突变次要是错义突变,招致单个氨基酸改动。突变型p53不只失往按捺肿瘤活性,还通过获得新的功用活性进一步促进癌症发作。此外,野生型p53和突变型p53还能够调剂肿瘤微情况(TME)。例如,p53能够通过掌握外泌体照顾的microRNA的构成和排泄细胞因子,按捺肿瘤停顿,从而庇护肿瘤分化形态和按捺中性粒细胞浸润。相反,突变型可通过调剂外泌体含量促进肿瘤停顿,巨噬细胞极化为M2形态,产生促进肿瘤的微情况。

小分子疗法

靶向TP53错义突变

TP53错义突变在癌症中尤为常见,约占所有TP53突变的70%。由此产生的构造或构象突变体被视为小分子的潜在靶点,能够恢复突变型p53的准确折叠和功用。CP31398,由辉瑞公司通过合成化合物库挑选确定,可恢复p53的转录活性,削减体内肿瘤生长。

靶向野生型P53

MDM2和MDM4按捺剂。几乎所有癌细胞中均存在MDM2-p53通路的反常,包罗p53突变和MDM2过表达,招致p53抑癌活性丧失。MDM2基因扩增或其他原因引起的MDM2过表达被认为是按捺野生型p53的次要机造之一,与不良的治疗响应和临床预后有关。

MDM2按捺剂通过阻断MDM2-p53彼此感化,有效按捺MDM2介导的p53泛素化和降解,最末招致含有野生型p53的肿瘤细胞中p53的增加和激活,而在p53缺失或突变的肿瘤细胞中则没有那种感化。

虽然MDM2按捺剂是一种有吸引力的战略,MDM2按捺剂仍存在两个次要的临床挑战,获得性耐药和对一般组织的毒性。p53不是癌症特异性靶标,几乎在所有一般组织中均有表达。MDM2按捺剂不只能激活癌细胞中的p53,还能激活一般细胞和组织中的p53,可能会对脾脏、骨髓、小肠等产生副感化。若何征服获得性耐药,有如下战略:

(1)将MDM2按捺剂与分子靶向药物或传统化疗药物结合利用;

(2)抉择性地将MDM2按捺剂递送到癌细胞。

MDM2相关卵白MDM4也是p53卵白重要的负调控因子。MDM4可间接与p53连系并按捺其转录活性。与MDM2一样,MDM4在许多癌症存在扩增,是一个有吸引力的治疗靶点。值得重视的是,血液系统恶性肿瘤大多保留了野生型p53,并伴随MDM2或MDM4表达升高。与MDM2差别,MDM4在白血病干细胞中高表达,使MDM4按捺剂成为白血病治疗特殊有前途的化合物。

比来,对MDM4与Nutlin 3a络合物的晶体构造阐发显示了新的分子间彼此感化,旨在加强Nutlin 3a与MDM4的连系亲和力。关于合成MDM2和MDM4按捺剂成为可能,能够按捺结曲肠癌和肺癌细胞系的生长。将来可开发同时靶向MDM2和MDM4的双靶点按捺剂。

研发MDM2 PROTAC降解剂。靶向卵白降解手艺PROTACs(卵白水解靶向嵌合体)和分子胶具有催化感化,即便在低剂量下也可发扬感化。PROTAC是一种异双功用分子,分子的一端毗连连系靶卵白的配体,一端毗连E3毗连酶的配体,中间通过适宜的Linker相连。PROTAC可介招致病靶卵白降解。WB156是一款高效的MDM2-PROTAC,WB156由Nutlin衍生物和CRBN配体来那度胺毗连而成(Nutlin是最早被发现能够按捺p53–MDM2彼此感化的小分子按捺剂)。MDM2-PROTAC可以有效降解MDM2,激活野生型p53,进而诱导细胞凋亡。但该分子只能在有限数量的白血病细胞系中起感化。

靶向p53截短突变

约10%的TP53突变属于无义突变。因而,人们提出了两种替代办法来激活含有p53截短突变癌细胞中的p53信号通路。第一种办法是基于促进翻译通读的分子,翻译机造绕过RNA末行密码子,产生全长p53卵白。那些化合物包罗氨基糖苷类抗生素,庆大霉素及其衍生物,如G418和新一代合成衍生物NB124。用那些氨基糖苷治疗可挽救完全p53的合成,促进癌细胞凋亡。另一种替代办法是按捺无义介导的mRNA降解(NMD)过程。例如,NMD14靶向SMG7的构造口袋,SMG7是NMD机造的一个关键构成部门。类似的药物,如ataluren,已经进进囊性纤维化的III期临床试验。

靶向突变型p53获得性功用

虽然大大都基于p53的药物开发都寄期看于恢复癌细胞中的野生型p53活性,但也有人试图通过靶向突变型p53,快速降解肃清mutp53获得性功用活性。鉴于HSP90热休克卵白能够削弱mutp53的降解,研究表白,长时间按捺HSP90能够进步照顾突变p53表达肿瘤小鼠的存活率。

基于p53的癌症免疫疗法

癌症免疫治疗的空前胜利,从头激发了基于p53治疗的兴致,期看进步免疫系统识别和杀伤失活p53癌细胞的战略。该战略的起点是,照顾TP53错义突变的癌细胞过度表达p53卵白,期看通过次要组织相容性复合体(MHCs)在其外表呈递更多的p53抗原肽。

值得重视的是突变p53的低效降解现实上可能限造而不是增加p53抗原肽的呈递。

基于p53的基因疗法

研究者们从头燃起了对基因治疗的热情。因为大大都癌细胞的p53信号通路都出缺陷,最间接的药物开发构想就是将野生型p53重返癌细胞。用CRISPR-Cas9碱基编纂处置HCC1954乳腺癌细胞,以将TP53错义突变转化为野生型序列,具有更高的特异性和更少的插进。碱基编纂后,7.6%的细胞中实现了TP53突变重返,只要0.7%的细胞展现出插进缺失。值得重视的是,要实现临床获益,必需在大大都癌细胞中实现胜利的转化。CRISPR-Cas9 TP53碱基编纂能否可能成为有效的治疗抉择?我们拭目以待。

面对的挑战

挑战1

基于p53的治疗的更大挑战是耐药。如对MDM2按捺剂耐药的一个明显机造是TP53基因的突变,在MDM2按捺剂Nutlin 3a治疗过程中得到证明。其他机造包罗抗凋亡基因的激活、对凋亡的抗性和MDM4的上调。

挑战2

p53药物不太可能零丁成药。多个研究在摸索结合给药。如BCL-2按捺剂venetoclax与idasanutlin结合,在原发性AML细胞中产生了有期看的效果,征服了对单一治疗的固有抗性,目前该结合给药已进进临床试验(NCT04029688),用于复发/难治性白血病和实体瘤的儿童。另p53激活剂与免疫治疗结合也极具吸引力。

挑战3

针对p53的药物体内试验次要在小鼠中停止。虽然小鼠模子是药物发现的原则东西,但小鼠和人有许多差别,包罗p53、MDM2和MDM4卵白序列的种间差别,以及p53信号通路的差别,若何绕过种间差别、加速把p53靶向药物推向临床?

挑战4

对P53根本生物学特征的深进理解。虽然挑选办法不竭改进,产生了越来越多的p53候选靶向药,但曲到给患者服用药物时才发现不成承受的毒性。因而,迫切需要加深对根本生物学的理解,以批示更有效靶向治疗的分子设想。

将来可期

靶向p53的治疗办法开发历经近三十年,招致人们对其成本效益的担忧。然而,基于p53变异在癌症中的核心地位,药物一旦开发胜利,有看彻底改动癌症的治疗格局。虽然靶向p53“高风险/高收益”,相关停顿逐步推翻p53“不成成药”的魔咒,但在成为原则治疗计划前,仍有许多工做期待摸索。KRAS按捺剂的最新停顿鼓励人心,曾因频频失败,KRAS一度被列为“不成成药”靶点。然而,跟着,FDA批准KRAS G12C突变靶向药物,提拔了人们对靶向p53治疗的自信心和期看。

跟着熟悉的深进,越来越清晰的是,精准的挑选从p53药物治疗中获益的人群至关重要,就像KRAS(G12C)按捺剂对照顾其他KRAS突变的患者没有好处一样。因而,精准的患者-药物婚配至关重要。幸运的是,因为p53功用反常在癌症中普及存在,即使对少数p53病例有治疗效果,也可以给大量患者带来受益。

参考材料

Hassin, O., Oren, M. Drugging p53 in cancer: one protein, many targets. Nat Rev Drug Discov (2022).

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