汉代的医官中职位更高者为太医令丞，从属关系上分为两个系统：
太常系统。“景帝中元六年（公元前144年）改名太常。属官有太乐、太祝、太宰、太史、太卜、太医令丞。”（《汉书.百宫公卿表》第七上)。其时的太医令丞，相当于后世太病院使，其内部有分工，负责与治理方药者各司其职，治理方药者又有典须方药和本草侍诏之分。典领方药偏重于丹方的研造，以供宫廷方药之需。而本草待诏则次要为皇家摘集各类药材，那些人不象典领方药官职不变，用着时被征诏上来，又随时可能破淘汰。
二是少府系统。“少府，秦官，掌山海池泽之税，以给供养，有六丞。属官有尚书、符节、太医、太官、汤官、导官、乐府、若卢、考工室、左弋居室、甜泉居室，摆布司空、东织西织，东园匠”等令（《汉书.百官公卿表》第七上）。少府太医次要为宫廷医疗办事。在少府太医令丞下，属官和医药人员有：太医监，多由有势力的医生充当，汉昭帝时权臣上官桀，其“妻父所幸充国为太医监。”（《汉书.孝昭上官皇后》）。汉代的侍医，沿袭秦造，次要为帝王皇室和诸侯王诊治疾病，相当于后世的侍御医。《汉书.王嘉传》中的侍医伍宏，在”董贤传”中称“医待诏”，为统一职称。女婢医、女医、乳医，在宫中次要为皇后、公主等办事，诊治妇产科疾病。
诸侯王府的医政模仿中心，如西汉同姓诸侯王府，济北王有太医高期、王禹；齐王有侍医。别的，王府中其别人也有爱好医方者。王府一方面培育提拔本身的医生，派人往名医那里请教、或拜名医为师肄业进修。父母官吏家中，也多有医药的设备。例如西汉高永侯的管家杜信，曾向淳于意进修《脉经》、《五色诊》等达两年。1973年在长沙马王堆出土的14种医药简帛书，为西汉时之一例。处所的郡、县、乡、亭四级机构中，有关医事轨制的可鉴史料较少。在县级政权中可能沿用了以前法医查验组织。亭一级设专门掌营“开闭拂拭”（《史记.高祖本纪》集解，见马非百《秦集史》第494页，中华书局1982年版）事务的亭父，由此可想知在郡、县，乡级的行政机构中，也会有掌管或兼管医药卫生之仕宦。下层人民“戌者死于边，输者偾于道。”（《汉书.主父偃传》）。“苍生靡敝，孤寡老弱不克不及相养，道死者相看。”（《汉书.晁错传》），缺医少药是显然可见的。
新莽期间设有太医尚方。史载“翟义党天孙庆捕得，莽使太医尚方与巧屠共刳剥之，量度五躲，以竹筵导其脉知所末始，云能够治病。”（《汉书.王莽传》）
东汉期间裁撤了太常系统，只在少府中设立太医令丞一人，六百石，掌诸医。部属医生293人，员吏19人负责诊疗及有关事项。此外，还有药丞、方丞各一人，别离掌握药物和医方。
宫廷中处置医务的人员还有：太医、侍医次要处置医疗工做；尚药监、中宫药长和尝药太官，次要处置药物的修和调试。“宫中药长一人，四百石。”（《后汉书.百官志》）。从东汉章帝、和帝以后，宫中官造设置扩展，增设的尝药太官之职，次要负责尝药。东汉期间侍疾尝药由专人负责，所尝药量要超越该剂药量的非常之二以上，且尝药不只限于尝药监一职。《后汉书》载“（帝）不豫，太医令丞将医进，就所宜药，尝药监、近臣、中常侍、小黄门、皆先尝药，过量十二，公卿朝臣问起居无间。”（《后汉书.礼节下》）
宫廷中所需药物，一般从全国各地进贡。汉代各郡国每年要问宫廷奉献处所的宝贵药材。对某些欠缺药材，太医令丞要及时派员摘购。顺帝时皇太子因病缺药，朝廷即派人“下郡国县出珍药”。（《后汉书.延笃传记》）。东汉朝臣也配有医官（相当于保健医生），除大鸿胪五人官医外，廷尉、卫尉、太仆、宗正、大司农、少府也各有一名官医（《后汉书.百官志》）。
东汉的医官轨制较西汉完美，增设了一些医药官职，处所医事不再由中心间接治理，而由处所负责。在诸候王国中设“医工长”，以”主医药”。（《后汉书.百官志》）在河北满城中山靖王刘胜墓中曾出土带有“医工”字样的铜盆。
汉代的医生，可分为官医与民间医生。官医的办事对象重点是权要统治阶层，从中心到处所构成了一收有组织的医疗系统。民间以师带徒教授医学的教导形式有必然开展，但官办的医学教导尚未构成，官医次要从民间医药人士中选用，（《汉书.龚胜传》），有的可能为暂时延聘。汉平帝元始五年（公元5年），“征全国通知逸经、古记、天文、历算、钟律、小学、史篇、方术、本草、及以五经、《论语》、《孝经》、《尔雅》传授者，一遣诣京师，至者数千人。”（《汉书.平帝纪》）但有时则淘汰官医，如西汉时令“侯绅方士、使者、副使、本草待诏七十余人皆回家。”（《汉书.郊祀志》），官医除了次要为统治者办事外，有些还被指派往为军中士卒、一般布衣、以至为刑徒、囚犯诊病。东汉京兆尹陈龟派官医为布衣治病。东汉时会稽发作大疫，督邮钟离意派官医“经给医药，所部多全济。”（《后汉书.钟离意传记》），孔融在《肉刑论》中说“置南甄宫使者，主养病徒。”桓帝建和三年诏称：“徒在做部，疾病致医药。”（《后汉书.恒帝纪》），又据洛阳南郊出土的东汉范雍砖志所记：“右部无任勉刑，颖川颖阴鬼薪范雍，不克不及往，留官致医。”便是让满刑的病徒陆续在刑徒区承受治疗。
汉代的医疗机构已逐步构成。西汉时的“乳舍”，相当于产院。据《风俗通义》记载：“汝南周霸，字翁仲，为太尉椽。妇于乳舍生女，自毒无男。时屠妇比卧生男，因相与私货易，裨钱数万。”，“颖川有富室，兄弟同居，两妇数月皆怀妊，长妇胎伤，因闭匿之。产期至，同到乳母舍，弟妇主男，夜因窃取之，争讼三年，州郡不克不及决。”（《承平御览》卷361），汝南、颖川均为汉代州郡，而更大一些的州郡及都会也可能设有乳舍，而且住院的产妇中有屠夫之妻，阐明产院其实不专为统治阶层而设。《后汉书.百官志》记载，掖庭令属下有暴室丞，“主中妇人疾病者，就此室治。”此相当于妇科诊疗室。
汉代为了掌握流民，在疫病大时髦期间曾设立过暂时病院。”元始二年（公元2年）郡国大旱蝗。……诏民疾疫者，舍空邸第，为置医药。”（《汉书.平帝纪》），元嘉元年（151）京师疫病时髦，朝廷派光禄医生与太医巡视疫情。在社会动乱、政权不稳的情状下，那些暂时防治疫病的组织也难以设置。